Căpitanul Pike este luat prizonier și este testat de extratereștri care au puterea de a proiecta iluzii incredibil de realiste.
Echipajul este urmărit de o creatură care își schimbă forma și extrage sarea din oameni. Când aceasta este adusă accidental la bord, Scotty trebuie să ia o decizie.
Puternicul mediu adolescent Charlie se teleportează la bord. Deși dorește să fie plăcut, îi atacă pe alții până când secretul puterilor sale îi este dezvăluit lui Kirk.
În timp ce Kirk și Spock investighează o tragedie a Flotei Stelare, un prieten de-al lui Kirk capătă puteri supraomenești. Pentru a-l opri, Kirk concepe un plan riscant.
Un virus face ca echipajul de pe Enterprise să-și piardă complet autocontrolul, iar Sulu amenință echipajul cu o sabie, Spock plânge și Bones caută un antidot.
Transportorul de pe Enterprise se defectează și-l teleportează pe Kirk la bord împreună cu sosia sa malefică. Apoi, Kirk și echipajul eșuează pe o planetă glacială.
Kirk și echipajul îi salvează pe Harry Mudd și trei „mirese la comandă” din serviciul său matrimonial. Mudd încearcă să-l împiedice pe Kirk să-l dea pe mâna justiției.
Enterprise îl caută pe faimosul om de știință Roger, ducându-l pe Kirk pe o planetă pustie unde Roger, care trăiește cu doi androizi cu aspect realist, îl atacă pe Kirk.
Enterprise ajunge pe o planetă unde un virus induce oamenilor o stare infantilă cronică. Când Kirk și echipa sa îi cad victime, doar Bones îi poate ajuta.
Un doctor dement scapă dintr-o colonie penală planetară și ajunge pe Enterprise. Kirk investighează, dar este spălat pe creier de directorul maniac al coloniei.
Enterprise scapă la limită de impunătoarea navă stelară a extraterestrului Balok, dar când acesta transmite un apel disperat, Kirk și echipajul îi sar în ajutor.
Spock îl răpește pe fostul căpitan al navei Enterprise, rănit, și stabilește direcția spre o planetă interzisă. Amenințat cu curtea marțială, Spock refuză să cedeze.
În timpul procesului lui Spock la curtea marțială, imaginile de la întâlnirea căpitanului Pike cu mediile talosiene dezvăluie motivul pentru care Spock a deturnat nava.
Kodos, un ucigaș în masă fugar, este actor în operele lui Shakespeare în secolul al XXIII-lea. Când un prieten este ucis, Kirk cere unei trupe de actori să investigheze.
Enterprise urmărește nave de război romulane care distrug avanposturi ale Federației. Similaritățile dintre aceștia și vulcanieni stârnesc resentimente față de Spock.
Enterprise aterizează pe o planetă pitorească pentru repaus, dar momentele idilice iau sfârșit când un samurai și un cavaler sângeros îi atacă pe Sulu și Bones.
Spock, Bones, Scotty și alții se prăbușesc pe o planetă unde sunt atacați de niște uriași mortali. Spock riscă viețile tuturor, chiar dacă are puține șanse de a-i salva.
Enterprise este capturată pe o planetă condusă de un extraterestru infantil fascinat de Napoleon, iar Kirk își oferă viața în schimbul libertății echipajului.
Extratereștrii îi răpesc pe Kirk și un gorn, un umanoid reptilian violent. Pentru a-și salva echipajele, Kirk și gornul trebuie să lupte până la moarte, dar Kirk refuză.
O stea neagră trimite nava Enterprise înapoi în timp, pe Pământ, în anii '60. Înainte de a putea reveni, Kirk și echipajul trebuie să distrugă toate dovezile vizitei lor.
Un ofițer este ucis într-un accident, iar înregistrările îl indică pe Kirk drept vinovat. Dovezile prezentate la curtea marțială dezvăluie că i-a fost făcută o înscenare.
Enterprise călătorește spre o planetă unde o navă a Flotei Stelare dispăruse cu ani în urmă și găsesc un computer tiranic, ce stăpânește poporul oprimat.
Nava Enterprise întâlnește supraoameni brutali conduși de Khan Noonien Singh, care se luptă cu Kirk pentru control, întorcând un coleg devotat împotriva Flotei Stelare.
Kirk ajunge pe o planetă unde membrii echipajului urmează să moară și află că se găsesc într-un război virtual, unde se comit sinucideri pentru a evita lupta adevărată.
Enterprise aterizează pe o planetă unde toți devin foarte pasivi și afectuoși unul cu celălalt. Kirk află cauza în scurt timp.
Kirk și Spock investighează de ce un monstru ucide mai mulți bărbați într-o colonie minieră. Spock află că ciudata creatură este inteligentă și are un motiv întemeiat.
Kirk încearcă să înființeze un avanpost pe o planetă locuită de aparent primitivii organieni. Când atacă klingonienii, organienii își arată adevăratul nivel al evoluției.
Kirk se întâlnește cu Lazarus, care pretinde că își urmărește sinele paralel prin spațiu și timp și, dacă Kirk nu îl ajută, întregul multivers este în pericol.
Bones călătorește înapoi în America anilor '30 și, din neatenție, distruge viitorul. Kirk și Spock călătoresc în timp ca să repare situația, iar Kirk se îndrăgostește.
Pe o altă planetă, fratele lui Kirk este ucis de extratereștri de tip amibă, care îl infectează și pe Spock. Leacul lui Bones are efecte secundare surprinzătoare.
În agonia perioadei de împerechere Pon Farr, Spock trebuie să se întoarcă pe Vulcan pentru a-și întâlni viitoarea soție hărăzită, cu care s-a logodit din copilărie.
Apare o puternică ființă ce se pretinde a fi zeul grec Apollo și îi cere echipajului să debarce pe planeta sa pentru a i se închina.
O sondă cu inteligență artificială și intenții criminale ajunge pe Enterprise și îl confundă pe căpitanul Kirk cu creatorul său.
Kirk, McCoy, Scotty și Uhura ajung într-un univers în oglindă la bordul unei nave Enterprise paralele, condusă de niște barbari nemiloși.
Kirk și o echipă de recunoaștere se teleportează pe ceea ce pare a fi o planetă ideală, edenică.
Enterprise întâlnește epava navei Constellation, al cărei căpitan agitat este hotărât să oprească uriașa navă ce i-a ucis echipajul.
Kirk și echipa de recunoaștere ajung jos pe planetă, unde găsesc cețuri ciudate, un castel întunecat, vrăjitoare, spiriduși și o pisică neagră.
Harry Mudd revine cu un plan de a prelua controlul navei Enterprise prin abandonarea echipajului pe o planetă populată de androizi aflați sub comanda sa.
Echipajul navei Enterprise întâlnește un misterios nor de energie care îi atrage spre planeta Gamma Canaris N, unde întâlnesc un naufragiat.
Enterprise găzduiește un număr de diplomați aflați în conflict, între care se află și tatăl lui Spock, dar unul dintre pasageri se gândește să înfăptuiască o crimă.
Federația concurează cu klingonienii pentru o alianță cu un trib războinic, locuitori ai planetei Capella IV.
Membrii echipei de recunoaștere de pe Enterprise sunt expuși la o formă de radiație care îi îmbătrânește rapid.
Căpitanul Kirk gonește obsesiv după o creatură misterioasă din nori, pe care a întâlnit-o în tinerețe.
Scotty este suspectat de uciderea unei dansatoare din buric.
Kirk trebuie să facă față birocraților Federației, unui crucișător klingonian și unui vânzător ambulant care vinde mici creaturi păroase și înfometate.
Kirk, Uhura și Chekov sunt capturați și întemnițați pe o planetă îndepărtată, unde sunt antrenați să joace spre amuzamentul unor extratereștri plictisiți.
Kirk, Spock și McCoy se teleportează și ajung într-o lume asemănătoare cu cea a bandelor din anii '20, de pe Pământ.
Enterprise întâlnește un organism spațial gigantic, care consumă energie și amenință galaxia.
Kirk revine pe planeta Neural, unde a stat o vreme în urmă cu 13 ani. Un prieten de-al lui Kirk, din vizita anterioară, a devenit conducătorul poporului său.
Ultimii trei membri ai unei rase străvechi, mult mai avansată decât cea umană, doresc să împrumute corpurile lui Kirk, Spock și dr. Mulhall.
Aflați în căutarea unui observator cultural dispărut al Federației, Kirk și Spock ajung pe o planetă a cărei cultură este modelată după partidul nazist.
Kirk, Spock, McCoy și câțiva membri ai echipajului se teleportează pe suprafața unei planete, răspunzând unui fals apel de ajutor.
Kirk descoperă că este încălcată prima directivă de către căpitanul Tracey de pe USS Exeter, care intervine în războiul dintre populațiile yang și kohm.
Enterprise este aleasă drept nava test pentru noul sistem computerizat multitronic M-5, proiectat să conducă navele fără ajutor din partea oamenilor.
Enterprise descoperă o planetă al cărei guvern despotic este o versiune de secol XX a Imperiului Roman de pe Pământ.
Enterprise primește misiunea de a observa istoria Pământului în 1968.
Un intrus misterios de pe Enterprise îi fură cu șiretenie creierul lui Spock, iar Bones încearcă să-l mențină în viață pe vulcanian, în timp ce Kirk urmărește hoțul.
La ordinele lui Kirk, Enterprise traversează deliberat Zona Neutră intrând în spațiul romulan și este înconjurată rapid de nave de război romulane.
Captiv pe o planetă ai cărei locuitori seamănă cu amerindienii, Kirk își pierde memoria și este proclamat zeu.
Enterprise ajunge la o colonie a Federației unde adulții s-au omorât între ei, dar copiii se joacă fără griji.
Enterprise îi transportă pe ambasadorul medusan Kollos, pe interpretul său telepatic, dr. Miranda Jones și pe inginerul Laurence Marvick.
Drept pedeapsă pentru pătrunderea neautorizată pe planeta lor, locuitorii îi condamnă pe căpitanul Kirk și echipa de recunoaștere să recreeze duelul de la O.K. Corral.
O entitate prinde echipajul de pe Enterprise și pe cel al unui crucișător klingonian dezafectat într-un război fără sfârșit, la bordul navei Enterprise.
Enterprise descoperă că un asteroid aparent aflat pe traiectoria unei coliziuni cu o planetă este de fapt o navă străveche populată.
Kirk și nava stelară abandonată Defiant dispar într-o interfază spațială între universuri.
Aflați într-o situație de urgență medicală, Kirk, Spock și McCoy întâlnesc o societate extraterestră care înflorise pe Pământ pe timpul lui Platon.
Enterprise răspunde unui apel de ajutor de pe planeta Scalos, dar membrii echipei de recunoaștere nu găsesc nicio ființă vie.
Prinși într-un laborator extraterestru, Kirk, Spock și McCoy întâlnesc un empath și sunt implicați într-o serie de experimente.
Enterprise îl transportă pe Elaan, un membru al dinastiei conducătoare a războinicilor elasieni, pe planeta dușmanilor acestora, troyienii.
Kirk și Spock sunt luați prizonieri de un fost căpitan de navă stelară care a preluat controlul unui azil pentru bolnavi mintal periculoși, al cărui pacient era.
Enterprise întâlnește doi extratereștri bicromatici care se războiesc între ei și prind nava la mijloc în vechiul lor conflict.
Kirk se teleportează pe planeta Gideon și pare să se găsească prins la bordul navei Enterprise, acum părăsită.
După ce membrii echipei de recunoaștere de pe Enterprise se teleportează pentru a investiga o planetă interesantă geologic, nava este azvârlită de-a lungul galaxiei.
Enterprise se află pe drum pentru a instala noi echipamente pe Memory Alpha, spațiul de depozitare a bibliotecii centrale a Federației.
Kirk, Spock și McCoy se teleportează pe o planetă presupus nelocuită pentru a colecta mineralul ryetalyn, necesar combaterii unei epidemii de febră rigeliană.
Enterprise primește ordinul de a urmări un grup de idealiști antisistem care au furat un crucișător spațial.
Kirk și Spock sunt prinși într-o revoluție pe o planetă în care intelectualii și artiștii locuiesc într-un oraș utopic, pe cer.
Kirk, Spock, Abraham Lincoln și Surak sunt aruncați în luptă împotriva a patru personaje negative notorii din istorie.
Planeta Sarpeidon urmează să fie distrusă de steaua sa, Beta Niobe, care devine o supernovă.
Kirk se confruntă cu ura profundă a unei vechi iubite, Janice Lester, care este grav bolnavă din cauza radiațiilor cu celebiu.