Dupa cum regizorul insusi povesteste, pe un ton amuzat, el a inceput sa regizeze inca de la varsta de 9 ani cand isi inventa propriile seturi de accesorii pentru papusi luminandu-le pe acestea din urma cu lanterna.
Isi cumpara prima camera de filmat la varsta de 17 ani. In timp ce-si realiza singur primele scurt-metraje, urmeaza in paralel cursuri de animatie.
In aceasta conjunctura se imprieteneste cu Marc Caro, designer si artist de comic books, care devine colaboratorul sau peren. Impreuna ajung sa realizeze diverse animatii premiate si sa regizeze diverse reclame si videoclipuri musicale– printre care se numara Zoolook al lui Jean Michel Jarre.
Primul film al celor doi (Jeunet si Caro) este Delicatessen (1991), o comedie neagra, proiectie a unei lumi apocaliptice bantuita de foamete in care macelarul magazinului de la parterul unui bloc, transeaza locatarii oameni pentru a-si hrani clientii.
In 1997 este invitat la Hollywood sa regizeze cel de-al patrulea film din seria Aliens – Aliens Ressurection. Acest succes ii ofera incredere si credibilitate in finantarea si realizarea noului sau proiect cinematografic, cel pentru care este cel mai recunoscut – Amelie.
Cei cu care colaboreaza adesea sunt: actrita Audrey Tautou, Marc Caro si actorul Dominique Pinon. Alte filme celebre din repertoriul sau includ: scurtmetrajul Foutaisses (Dominique Pinon) si A very long engagement cu Audrey Tautou.