Jonathan Frakes, pe numele complet Jonathan Scott Frakes, s-a născut la data de 19.08.1952, în Bellefonte, Pennsylvania, SUA. Este fiul lui Doris J. (Yingling) și al doctorului James R. Frakes, profesor. Părinții lui s-au mutat împreună cu Jonathan și fratele său mai mic Daniel, la Betleem, în estul Pennsylvania. Acolo, tatăl său a predat limba engleză la Universitatea Lehigh, unde a deținut catedra Fairchild în literatura americană până la moartea sa în 2002. Frakes este de origine germană și engleză. Jonathan a fost introdus în jazz de tatăl său și a început să cânte la trombon când era în clasa a patra. În copilărie, Jonathan a fost întotdeauna prietenos, amuzant și oarecum actor, potrivit unui prieten din copilărie. În liceu a cântat în trupă. A frecventat Universitatea Penn State și Universitatea Harvard. A cântat la trombon în Blue Band la Universitatea Penn State. A absolvit Liberty High din Betleem în 1970. A doua zi după ce a absolvit, a început cursurile la Universitatea de Stat din Pennsylvania, înscriindu-se ca doctor în psihologie. În vara următoare a lucrat ca portar pentru teatrul local și i-a observat pe colegii săi bucurându-se din plin de actorie. A fost motivat să-și schimbe specializarea în arte teatrale și a absolvit cu licență în 1974. A decis să se mute în New York și să devină actor. Rolurile nu au venit cu ușurință, așa că a trebuit să ocupe locuri de muncă secundare, cum ar fi un chelner, un lucrător pentru mutarea mobilierului (unde și-a rănit spatele) și pe post de căpitan America pentru Marvel Comics. Între timp, a câștigat roluri în musicalul de pe Broadway „Shenandoah” și în telenovela The Doctors (1969) în rolul veteranului vietnamez Tom Carroll din 1977 până în 1978. La îndemnul agentului său, Jonathan s-a mutat la Los Angeles la sfârșitul anului 1978, pentru a juca la televiziune în producții, precum: The Waltons (1972), Barnaby Jones (1973), Îngerii lui Charlie (1976), Quincy ME (1976), Fantasy Island (1977), The Dukes of Hazzard (1979), Bare Essence (1983), Highway to Heaven (1984), North and South (1985). După ce a petrecut mai mult de șase luni filmând în tot sudul Statelor Unite, el și partenera sa, Genie Francis, s-au îndrăgostit (o cunoscuse cu trei ani înainte când au jucat în Bare Essence). La începutul anului 1987, Jonathan a participat la o audiție pentru un nou serial de televiziune, la îndemnul viitoarei sale soții și a familiei sale. După șase săptămâni și șapte audiții, el a câștigat rolul care îi va aduce faima la nivel mondial: cel al comandantului William Riker în Star Trek: The Next Generation (1987). În acest moment, el și Genie și-au anunțat logodna. Vor fi nevoiți să-și amâne nunta de două ori din cauza slujbei sale, dar în cele din urmă s-au căsătorit în pauza din primul sezon pe 28 mai 1988. Toți noii săi parteneri au participat la nuntă, împreună cu creatorul Star Trek (1966), Gene Roddenberry. În cei șapte ani în care Frakes a jucat în acest serial, a descoperit că are talent pentru regie. A condus opt episoade în total și a fost invitat să regizeze în spin-off-urile Next Generation, Star Trek: Deep Space Nine (1993) și Star Trek: Voyager (1995). A doua zi după împlinirea a 42 de ani, pe 20 august, s-a născut fiul său, Jameson Ivor Frakes. Jameson poartă numele bunicilor săi, regretatul James Frakes și al regretatului actor Ivor Francis, tatăl lui Genie. În acest timp, Jonathan nu a lucrat, preferând să rămână acasă și să-și crească fiul cu soția sa. În următorii doi ani a făcut câteva apariții la televizor. În 1996 a regizat Star Trek: First Contact. El a primit laude pentru munca sa în film și a devenit cea mai mare încasare a francizei până în prezent. A format o companie de producție, Goepp Circle Productions, numită după strada pe care locuia în Bethlehem, Pennsylvania. La doar două zile după cea de-a noua aniversare a nunții sale, în 1997, s-a născut Elizabeth Francis Frakes. Din păcate, cu doar două săptămâni înainte, fratele lui Jonathan, Daniel, a murit de cancer pancreatic. A dat vocea lui David Xanatos din Gargoyles (1994) și Gargoyles: The Goliath Chronicles (1996). În 1998 i s-a cerut să regizeze al nouălea film Star Trek, Star Trek: Insurrection (1998). După recenzii mixte pentru acest film, el a continuat să regizeze filme și la televiziune, a jucat în câteva roluri care nu sunt Star Trek și a jucat în al zecelea film Star Trek, Star Trek: Nemesis (2002). În plan personal, el este căsătorit cu actrița Genie Francis, din 1988 și în prezent; au doi copii: Jameson Ivor Frakes (născut la 20 august 1994) și Elizabeth Francis Frakes (născut la 30 mai 1997). Este membru al Lambda Chi Alpha Fraternity. Ellen J. Hornstein este asistentul său personal / editor de poveste pentru compania sa de producție, Goepp Circle Productions. Barbă poartă din 1986. A scris cartea SF "The Abductors: Conspiracy" împreună cu Dean Wesley Smith. El și soția sa au interpretat un cuplu căsătorit în trei producții diferite: Camp Nowhere (1994), Lois & Clark: The New Adventures of Superman (1993) și 3rd Rock from the Sun (1996). S-a alăturat facultății Rockport College din Maine, predând cursuri de regie de film și televiziune. Prieten foarte bun cu partenera sa din Star Trek, Marina Sirtis. Alături de David Carson, el este unul dintre cei doi oameni care au regizat „Star Trek” atât pentru televiziune, cât și pentru film. A regizat opt episoade din Star Trek: The Next Generation (1987), trei episoade din Star Trek: Deep Space Nine (1993), trei episoade din Star Trek. Voyager (1995), Star Trek: First Contact (1996), Star Trek: Insurrection (1998) și trei episoade din Star Trek: Discovery (2017). A participat la Motor City Comic Convention din Michigan alături de soția sa, Genie Francis, în mai 2006. Locuiește în Londra cu soția și copiii lor.